Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNI2P48788 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNI2P48788 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI2P48788 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNI2P48788 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms