Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX9P48436 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX9P48436 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX9P48436 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX9P48436 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX9P48436 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX9P48436 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX9P48436 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX9P48436 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX9P48436 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX9P48436 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX9P48436 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX9P48436 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX9P48436 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX9P48436 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX9P48436 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX9P48436 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX9P48436 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX9P48436 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX9P48436 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX9P48436 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX9P48436 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX9P48436 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX9P48436 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX9P48436 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX9P48436 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX9P48436 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX9P48436 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX9P48436 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX9P48436 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX9P48436 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX9P48436 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX9P48436 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX9P48436 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX9P48436 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX9P48436 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX9P48436 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX9P48436 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX9P48436 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX9P48436 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX9P48436 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX9P48436 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX9P48436 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX9P48436 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX9P48436 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX9P48436 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX9P48436 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX9P48436 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX9P48436 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX9P48436 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX9P48436 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX9P48436 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX9P48436 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX9P48436 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX9P48436 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX9P48436 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX9P48436 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX9P48436 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX9P48436 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX9P48436 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX9P48436 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX9P48436 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX9P48436 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX9P48436 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX9P48436 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX9P48436 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX9P48436 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX9P48436 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX9P48436 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX9P48436 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX9P48436 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX9P48436 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX9P48436 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX9P48436 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX9P48436 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX9P48436 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX9P48436 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX9P48436 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX9P48436 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX9P48436 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX9P48436 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX9P48436 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX9P48436 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX9P48436 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX9P48436 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX9P48436 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX9P48436 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX9P48436 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX9P48436 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX9P48436 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX9P48436 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX9P48436 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX9P48436 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX9P48436 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX9P48436 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX9P48436 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX9P48436 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX9P48436 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX9P48436 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX9P48436 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms