Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XCR1P46094 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XCR1P46094 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XCR1P46094 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XCR1P46094 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XCR1P46094 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XCR1P46094 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XCR1P46094 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XCR1P46094 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XCR1P46094 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XCR1P46094 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XCR1P46094 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XCR1P46094 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XCR1P46094 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XCR1P46094 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XCR1P46094 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
XCR1P46094 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XCR1P46094 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XCR1P46094 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XCR1P46094 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XCR1P46094 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XCR1P46094 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XCR1P46094 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XCR1P46094 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XCR1P46094 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XCR1P46094 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XCR1P46094 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XCR1P46094 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XCR1P46094 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XCR1P46094 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XCR1P46094 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XCR1P46094 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XCR1P46094 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XCR1P46094 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XCR1P46094 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XCR1P46094 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XCR1P46094 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XCR1P46094 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XCR1P46094 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XCR1P46094 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XCR1P46094 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XCR1P46094 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XCR1P46094 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XCR1P46094 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XCR1P46094 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XCR1P46094 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCR1P46094 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCR1P46094 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCR1P46094 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCR1P46094 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCR1P46094 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCR1P46094 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCR1P46094 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCR1P46094 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XCR1P46094 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XCR1P46094 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XCR1P46094 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XCR1P46094 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XCR1P46094 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XCR1P46094 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XCR1P46094 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XCR1P46094 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XCR1P46094 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XCR1P46094 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XCR1P46094 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XCR1P46094 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XCR1P46094 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XCR1P46094 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XCR1P46094 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XCR1P46094 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XCR1P46094 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XCR1P46094 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XCR1P46094 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XCR1P46094 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms