Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL35P42766 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL35P42766 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL35P42766 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL35P42766 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL35P42766 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL35P42766 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL35P42766 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL35P42766 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL35P42766 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL35P42766 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL35P42766 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL35P42766 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL35P42766 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL35P42766 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL35P42766 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL35P42766 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL35P42766 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL35P42766 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL35P42766 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL35P42766 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL35P42766 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL35P42766 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL35P42766 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL35P42766 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL35P42766 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL35P42766 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL35P42766 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL35P42766 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL35P42766 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL35P42766 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL35P42766 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL35P42766 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL35P42766 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL35P42766 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL35P42766 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL35P42766 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL35P42766 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL35P42766 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL35P42766 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL35P42766 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL35P42766 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL35P42766 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL35P42766 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL35P42766 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL35P42766 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL35P42766 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL35P42766 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL35P42766 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL35P42766 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL35P42766 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL35P42766 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL35P42766 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL35P42766 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL35P42766 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL35P42766 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms