Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP214P35658 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP214P35658 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP214P35658 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP214P35658 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP214P35658 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP214P35658 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP214P35658 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP214P35658 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP214P35658 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP214P35658 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP214P35658 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP214P35658 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP214P35658 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP214P35658 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP214P35658 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP214P35658 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP214P35658 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP214P35658 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP214P35658 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP214P35658 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP214P35658 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP214P35658 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP214P35658 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP214P35658 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP214P35658 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP214P35658 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP214P35658 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP214P35658 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP214P35658 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUP214P35658 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUP214P35658 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP214P35658 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP214P35658 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP214P35658 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP214P35658 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP214P35658 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP214P35658 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP214P35658 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP214P35658 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP214P35658 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP214P35658 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP214P35658 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP214P35658 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP214P35658 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP214P35658 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP214P35658 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP214P35658 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP214P35658 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP214P35658 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP214P35658 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP214P35658 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP214P35658 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP214P35658 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP214P35658 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP214P35658 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP214P35658 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP214P35658 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP214P35658 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP214P35658 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP214P35658 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP214P35658 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP214P35658 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP214P35658 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP214P35658 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP214P35658 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP214P35658 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP214P35658 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP214P35658 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP214P35658 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP214P35658 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP214P35658 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms