Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDXP35241 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDXP35241 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RDXP35241 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDXP35241 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDXP35241 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDXP35241 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDXP35241 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDXP35241 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDXP35241 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDXP35241 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDXP35241 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDXP35241 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDXP35241 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDXP35241 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RDXP35241 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDXP35241 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDXP35241 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDXP35241 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDXP35241 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDXP35241 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDXP35241 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDXP35241 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDXP35241 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDXP35241 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDXP35241 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDXP35241 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDXP35241 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RDXP35241 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDXP35241 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDXP35241 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDXP35241 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDXP35241 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDXP35241 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDXP35241 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RDXP35241 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RDXP35241 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDXP35241 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDXP35241 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDXP35241 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDXP35241 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDXP35241 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDXP35241 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDXP35241 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDXP35241 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDXP35241 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDXP35241 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDXP35241 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDXP35241 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDXP35241 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDXP35241 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDXP35241 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDXP35241 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDXP35241 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDXP35241 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDXP35241 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDXP35241 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDXP35241 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDXP35241 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDXP35241 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RDXP35241 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDXP35241 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDXP35241 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDXP35241 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDXP35241 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDXP35241 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDXP35241 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDXP35241 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDXP35241 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDXP35241 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDXP35241 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDXP35241 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDXP35241 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDXP35241 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RDXP35241 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDXP35241 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDXP35241 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDXP35241 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDXP35241 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDXP35241 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDXP35241 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDXP35241 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDXP35241 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDXP35241 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDXP35241 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDXP35241 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDXP35241 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RDXP35241 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDXP35241 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RDXP35241 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms