Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRMP28827 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRMP28827 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PTPRMP28827 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRMP28827 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
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