Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP11P24347 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP11P24347 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP11P24347 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP11P24347 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP11P24347 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP11P24347 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP11P24347 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP11P24347 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP11P24347 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP11P24347 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP11P24347 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP11P24347 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP11P24347 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP11P24347 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP11P24347 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP11P24347 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP11P24347 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP11P24347 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP11P24347 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP11P24347 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP11P24347 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP11P24347 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP11P24347 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP11P24347 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP11P24347 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP11P24347 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP11P24347 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP11P24347 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP11P24347 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP11P24347 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP11P24347 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP11P24347 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP11P24347 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP11P24347 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP11P24347 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP11P24347 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP11P24347 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP11P24347 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP11P24347 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP11P24347 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP11P24347 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP11P24347 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP11P24347 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP11P24347 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP11P24347 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP11P24347 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP11P24347 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP11P24347 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP11P24347 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP11P24347 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP11P24347 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP11P24347 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP11P24347 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP11P24347 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP11P24347 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP11P24347 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP11P24347 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP11P24347 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP11P24347 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP11P24347 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP11P24347 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP11P24347 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP11P24347 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP11P24347 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP11P24347 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP11P24347 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP11P24347 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP11P24347 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP11P24347 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP11P24347 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP11P24347 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP11P24347 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms