Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP100P23497 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP100P23497 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP100P23497 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP100P23497 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP100P23497 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP100P23497 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP100P23497 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP100P23497 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP100P23497 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP100P23497 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP100P23497 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP100P23497 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP100P23497 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP100P23497 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP100P23497 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP100P23497 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP100P23497 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP100P23497 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP100P23497 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP100P23497 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP100P23497 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP100P23497 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP100P23497 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP100P23497 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SP100P23497 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP100P23497 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP100P23497 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP100P23497 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP100P23497 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP100P23497 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP100P23497 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP100P23497 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP100P23497 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP100P23497 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP100P23497 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP100P23497 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP100P23497 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP100P23497 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP100P23497 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP100P23497 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP100P23497 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP100P23497 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP100P23497 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP100P23497 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP100P23497 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP100P23497 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP100P23497 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SP100P23497 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP100P23497 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP100P23497 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP100P23497 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP100P23497 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP100P23497 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP100P23497 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP100P23497 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP100P23497 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP100P23497 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP100P23497 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP100P23497 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP100P23497 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SP100P23497 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP100P23497 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP100P23497 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP100P23497 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP100P23497 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP100P23497 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP100P23497 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP100P23497 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP100P23497 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP100P23497 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP100P23497 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SP100P23497 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP100P23497 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP100P23497 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP100P23497 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP100P23497 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP100P23497 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP100P23497 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP100P23497 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP100P23497 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP100P23497 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SP100P23497 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP100P23497 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP100P23497 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP100P23497 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP100P23497 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP100P23497 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.9 ms