Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRZ1P23471 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRZ1P23471 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRZ1P23471 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRZ1P23471 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRZ1P23471 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms