Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT4P19013 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT4P19013 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT4P19013 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT4P19013 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT4P19013 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT4P19013 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT4P19013 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT4P19013 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT4P19013 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT4P19013 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT4P19013 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT4P19013 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT4P19013 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT4P19013 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT4P19013 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT4P19013 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT4P19013 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT4P19013 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT4P19013 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT4P19013 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT4P19013 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT4P19013 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT4P19013 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT4P19013 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT4P19013 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT4P19013 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT4P19013 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT4P19013 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT4P19013 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT4P19013 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT4P19013 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT4P19013 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT4P19013 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT4P19013 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT4P19013 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT4P19013 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT4P19013 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT4P19013 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT4P19013 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT4P19013 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT4P19013 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT4P19013 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT4P19013 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT4P19013 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT4P19013 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT4P19013 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT4P19013 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT4P19013 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT4P19013 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT4P19013 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT4P19013 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT4P19013 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT4P19013 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT4P19013 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT4P19013 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT4P19013 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT4P19013 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT4P19013 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT4P19013 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT4P19013 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT4P19013 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT4P19013 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT4P19013 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT4P19013 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT4P19013 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT4P19013 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT4P19013 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT4P19013 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT4P19013 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms