Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKBP12277 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKBP12277 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKBP12277 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKBP12277 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKBP12277 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKBP12277 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKBP12277 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKBP12277 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKBP12277 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKBP12277 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CKBP12277 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKBP12277 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKBP12277 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKBP12277 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKBP12277 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKBP12277 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKBP12277 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKBP12277 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKBP12277 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKBP12277 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKBP12277 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKBP12277 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKBP12277 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKBP12277 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKBP12277 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKBP12277 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKBP12277 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKBP12277 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKBP12277 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKBP12277 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKBP12277 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKBP12277 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKBP12277 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKBP12277 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CKBP12277 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKBP12277 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CKBP12277 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKBP12277 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CKBP12277 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKBP12277 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CKBP12277 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKBP12277 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKBP12277 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKBP12277 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKBP12277 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKBP12277 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKBP12277 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKBP12277 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKBP12277 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKBP12277 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKBP12277 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKBP12277 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKBP12277 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKBP12277 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKBP12277 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKBP12277 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKBP12277 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKBP12277 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKBP12277 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKBP12277 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKBP12277 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKBP12277 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKBP12277 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKBP12277 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKBP12277 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKBP12277 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CKBP12277 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKBP12277 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKBP12277 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CKBP12277 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CKBP12277 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CKBP12277 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKBP12277 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKBP12277 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKBP12277 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKBP12277 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKBP12277 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKBP12277 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKBP12277 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKBP12277 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKBP12277 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKBP12277 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKBP12277 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKBP12277 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKBP12277 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKBP12277 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKBP12277 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKBP12277 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CKBP12277 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms