Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX6A1P12074 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX6A1P12074 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX6A1P12074 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms