Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3P09919 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3P09919 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSF3P09919 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSF3P09919 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSF3P09919 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3P09919 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3P09919 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3P09919 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3P09919 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3P09919 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3P09919 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3P09919 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3P09919 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3P09919 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3P09919 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3P09919 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3P09919 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3P09919 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3P09919 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3P09919 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3P09919 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3P09919 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3P09919 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3P09919 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3P09919 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3P09919 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3P09919 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3P09919 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3P09919 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3P09919 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3P09919 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF3P09919 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF3P09919 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3P09919 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3P09919 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3P09919 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3P09919 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3P09919 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3P09919 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF3P09919 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3P09919 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3P09919 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3P09919 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3P09919 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3P09919 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSF3P09919 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3P09919 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3P09919 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3P09919 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3P09919 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3P09919 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3P09919 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3P09919 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSF3P09919 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF3P09919 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3P09919 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3P09919 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF3P09919 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3P09919 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3P09919 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3P09919 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3P09919 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3P09919 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3P09919 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF3P09919 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3P09919 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3P09919 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3P09919 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF3P09919 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms