Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP1P09430 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP1P09430 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP1P09430 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP1P09430 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP1P09430 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP1P09430 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP1P09430 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP1P09430 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP1P09430 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP1P09430 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TNP1P09430 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TNP1P09430 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TNP1P09430 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms