Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNW1P05000 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFNW1P05000 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNW1P05000 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms