Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MT-ND1P03886 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND1P03886 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND1P03886 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms