Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRPM2O94759 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRPM2O94759 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRPM2O94759 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms