Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDK2AP2O75956 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK2AP2O75956 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms