Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG13O75143 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG13O75143 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG13O75143 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG13O75143 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG13O75143 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG13O75143 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG13O75143 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG13O75143 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG13O75143 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG13O75143 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG13O75143 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG13O75143 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG13O75143 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG13O75143 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG13O75143 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG13O75143 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG13O75143 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG13O75143 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG13O75143 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG13O75143 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG13O75143 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG13O75143 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG13O75143 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG13O75143 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG13O75143 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG13O75143 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG13O75143 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG13O75143 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG13O75143 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG13O75143 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG13O75143 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG13O75143 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG13O75143 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG13O75143 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG13O75143 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG13O75143 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG13O75143 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG13O75143 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG13O75143 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG13O75143 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG13O75143 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG13O75143 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG13O75143 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG13O75143 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG13O75143 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG13O75143 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG13O75143 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG13O75143 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG13O75143 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG13O75143 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG13O75143 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG13O75143 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG13O75143 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG13O75143 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG13O75143 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG13O75143 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG13O75143 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG13O75143 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG13O75143 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG13O75143 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG13O75143 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG13O75143 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG13O75143 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG13O75143 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG13O75143 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG13O75143 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG13O75143 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG13O75143 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG13O75143 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG13O75143 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG13O75143 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG13O75143 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG13O75143 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG13O75143 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG13O75143 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG13O75143 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG13O75143 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG13O75143 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG13O75143 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG13O75143 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG13O75143 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG13O75143 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG13O75143 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG13O75143 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG13O75143 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG13O75143 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG13O75143 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG13O75143 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG13O75143 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG13O75143 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms