Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBNO60934 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBNO60934 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBNO60934 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBNO60934 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBNO60934 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBNO60934 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBNO60934 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBNO60934 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBNO60934 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBNO60934 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBNO60934 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBNO60934 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NBNO60934 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBNO60934 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBNO60934 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBNO60934 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NBNO60934 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBNO60934 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBNO60934 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBNO60934 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBNO60934 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBNO60934 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NBNO60934 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NBNO60934 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NBNO60934 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NBNO60934 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NBNO60934 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBNO60934 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBNO60934 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBNO60934 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBNO60934 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBNO60934 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBNO60934 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBNO60934 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBNO60934 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBNO60934 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBNO60934 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBNO60934 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBNO60934 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBNO60934 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBNO60934 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBNO60934 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBNO60934 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBNO60934 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBNO60934 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBNO60934 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBNO60934 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBNO60934 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBNO60934 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NBNO60934 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBNO60934 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBNO60934 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBNO60934 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBNO60934 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBNO60934 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBNO60934 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBNO60934 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBNO60934 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBNO60934 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBNO60934 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBNO60934 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBNO60934 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBNO60934 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBNO60934 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBNO60934 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NBNO60934 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBNO60934 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBNO60934 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBNO60934 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBNO60934 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms