Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF2O60811 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF2O60811 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms