Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF10O60809 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF10O60809 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms