Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSCO60682 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSCO60682 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MSCO60682 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MSCO60682 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSCO60682 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSCO60682 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSCO60682 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSCO60682 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSCO60682 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSCO60682 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSCO60682 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSCO60682 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSCO60682 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSCO60682 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSCO60682 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSCO60682 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSCO60682 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSCO60682 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MSCO60682 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSCO60682 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSCO60682 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSCO60682 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MSCO60682 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSCO60682 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSCO60682 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSCO60682 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSCO60682 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSCO60682 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSCO60682 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSCO60682 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSCO60682 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSCO60682 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSCO60682 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSCO60682 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MSCO60682 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSCO60682 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSCO60682 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSCO60682 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSCO60682 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSCO60682 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSCO60682 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSCO60682 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSCO60682 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSCO60682 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSCO60682 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSCO60682 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSCO60682 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSCO60682 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSCO60682 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSCO60682 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MSCO60682 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSCO60682 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSCO60682 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSCO60682 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSCO60682 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSCO60682 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSCO60682 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSCO60682 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MSCO60682 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSCO60682 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSCO60682 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSCO60682 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSCO60682 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSCO60682 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSCO60682 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSCO60682 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSCO60682 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSCO60682 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSCO60682 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSCO60682 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSCO60682 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSCO60682 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSCO60682 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSCO60682 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSCO60682 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MSCO60682 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSCO60682 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSCO60682 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSCO60682 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSCO60682 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MSCO60682 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MSCO60682 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSCO60682 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSCO60682 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MSCO60682 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSCO60682 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSCO60682 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSCO60682 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSCO60682 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSCO60682 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms