Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD2O60548 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms