Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMM44O43615 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMM44O43615 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMM44O43615 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms