Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF14O43557 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFSF14O43557 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFSF14O43557 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms