Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1CO15160 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1CO15160 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1CO15160 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms