Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR3AO14802 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR3AO14802 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLR3AO14802 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLR3AO14802 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLR3AO14802 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR3AO14802 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR3AO14802 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
POLR3AO14802 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
POLR3AO14802 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms