Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NL46 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NL46 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NL46 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NL46 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NL46 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NL46 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NL46 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NL46 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NL46 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NL46 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NL46 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NL46 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NL46 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NL46 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NL46 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NL46 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NL46 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NL46 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NL46 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NL46 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NL46 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NL46 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NL46 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NL46 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NL46 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NL46 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NL46 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NL46 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NL46 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NL46 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NL46 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NL46 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NL46 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NL46 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NL46 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NL46 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NL46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NL46 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NL46 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NL46 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NL46 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NL46 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NL46 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NL46 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NL46 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NL46 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NL46 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NL46 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NL46 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NL46 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NL46 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NL46 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NL46 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NL46 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NL46 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NL46 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NL46 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NL46 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NL46 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NL46 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NL46 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms