Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMP2A6NFY4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms