Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC189A1A4V9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC189A1A4V9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC189A1A4V9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms