Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAARA0A1B0GVQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms