Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms