Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms