Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PROX1Q92786 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms