Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCDD1LQ8NCL9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms