Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms