Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC153Q494R4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms