Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms