Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP9P55211 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP9P55211 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms