Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RGS4P49798 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RGS4P49798 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RGS4P49798 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms