Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNUPNO95149 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNUPNO95149 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms