Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRPF3Q9ULD4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRPF3Q9ULD4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms