Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD27Q96NW4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250 ms