Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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