Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RABEP1Q15276 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms