Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX1Q04741 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms