Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN8P56748 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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