Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA4P54764 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA4P54764 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms